Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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