Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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