Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATMQ13315 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATMQ13315 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
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