Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms