Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms