Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms