Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP4Q13115 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms