Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRDM2Q13029 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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