Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
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