Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms