Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPFP49454 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPFP49454 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPFP49454 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPFP49454 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPFP49454 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPFP49454 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPFP49454 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPFP49454 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPFP49454 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPFP49454 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPFP49454 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPFP49454 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPFP49454 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CENPFP49454 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPFP49454 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CENPFP49454 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms