Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNS3Q9BQ31 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms