Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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RTL8BQ17RB0 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RTL8BQ17RB0 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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RTL8BQ17RB0 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
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RTL8BQ17RB0 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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RTL8BQ17RB0 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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