Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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