Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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