Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BECN1Q14457 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms