Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EXOSC2Q13868 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms