Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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