Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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