Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
APOFQ13790 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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