Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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