Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTCH1Q13635 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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