Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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BFSP2Q13515 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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