Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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