Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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