Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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RPA4Q13156 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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