Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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