Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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