Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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