Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCSER1Q9C0I3 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms