Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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