Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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