Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms