Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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