Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3AQ14563 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms