Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms