Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
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COL4A6Q14031 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL4A6Q14031 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms