Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms