Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1SQ13698 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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