Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTCH1Q13635 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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