Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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