Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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