Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms