Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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