Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNB1Q02641 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms