Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CENPEQ02224 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms