Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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PTPRAP18433 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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