Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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