Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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