Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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